Можно предположить следующее:
1) Полигон ТБО – это ФИРМА (предприятие, организация), поэтому название пишется в кавычках.
"В представлении многих обывателей полигон твердых бытовых отходов – это обычная городская свалка. Однако, это мнение является ошибочным. Полигон твердых бытовых отходов является довольно сложным инженерным сооружением, которое не только обеспечивает складирование мусора, но и выполняет другие природоохранные задачи – защищает почвы, подземные воды и воздух от вредного влияния продуктов разложения".
Полигон твердых бытовых отходов – что это такое?
2) Военный полигон – это "большой, специально оборудованный УЧАСТОК для испытания различных видов оружия, боевых средств и техники, а также для проведения боевых учений". Поэтому название полигона по своей форме соответствует названиям ТЕРРИТОРИАЛЬНЫХ административных единиц (городов, поселений и т.д.).