Если однородные придаточные части соединены разными одиночными сочинительными союзами, запятые между ними не ставятся.
http://orthographia.ru/punctum_uk.php?rid=376#pg376
Он подумал, (что /скоро ехать, а вещи еще не собраны/) и (что надо бы поторопиться).
Только структура этого предложения не повторяет структуру предложения из указанного вопроса, здесь логика построения предложения соблюдена, хотя структура и необычна: ...что скоро ехать, а вещи не собраны...- это и соподчинённые придаточные, и в то же время они соединены между собой сочинительной противительной связью, такой вот "дуплексив".
В том предложении нарушена логика построения противительной связи: просрочка зафиксирована в документах, а лист не исполнен. В чём противоречие? А если б не была зафиксирована, то лист был бы исполнен? Как неисполнение влияет на фиксацию? Логично поменять местами: лист не исполнен, а эта просрочка зафиксирована.Сначала лист не исполнен, а потом это неисполнение, просрочку, зафиксировали. так что всё равно здесь грамматическая ошибка построения предложения.