Боюсь, что придётся оборот с перечислением заключить в скобки, поскольку не видно другого способа обозначить его окончание (тире уже использованы внутри него). А сделать это необходимо, поскольку здесь применена вставка (сказуемое по падежу согласовано с "комиссия"). Перед "при специалисте" знак нужен (если только Иванов с Петровым не "при Сидорове"), и нужно поставить точку с запятой, чтобы исключить Сидорова из перечисления, в котором есть свои запятые (в составе таком-то; при участии такого-то консультанта). В скобках возможны и другие варианты указания состава комисии.
Комиссия главного антикризисного управления (в составе: председателя - директора управления, двух независимых экспертов - Иванова и Петрова; при участии специалиста Сидорова) решила следующее.