Викисловарь:
Корень: -зонт-; суффикс: -ик [Тихонов, 1996].
Происходит от нидерл. zonnedek «навес от солнца». Zondek — сложение zon «солнце» и dek «покрышка». Первонач. слово морск. языка. Русск. зонт, зо́нтик; стар. зондек «тент, полотно или парусина, растягиваемые над палубой (для защиты от солнца и дождя)», Уст. морск. 1720 г. Использованы данные словаря М. Фасмера.
Прочитал здесь, что версия происхождения может быть не точной. Тем не менее, если принять её как верную, как исторически получилось, что суффикс "откололся" от корня? Возможно, по обратному принципу (пришло полностью, затем использовали краткую форму, а после вернулись к начальной и приняли её как уменьшительную)?