Да, мне трудно работать над этим проектом и задачи кажутся невыполнимыми, но я справлюсь.
Слова «да» и «нет» позволяют не ставить запятую в ССП, являясь общими обособленными частицами?
Думаю, что речь здесь идет не об обособленной частице, а о слове-предложении — "да".
Такое предложение состоит из одного слова и выражает эмоциональную или волевую реакцию говорящего на ситуацию (в нашем случае это утверждение).
Слова-предложения представляют собой особый структурный тип и не могут быть отнесены ни к двусоставным предложениям, ни к односоставным.
Мне кажется, что слово да относится к обеим частям предложения, является для них общим, поэтому запятая перед и не нужна.
(Сравните: Да, мне трудно работать над этим проектом. Да, задачи кажутся невыполнимыми. Но я справлюсь. — Вторая часть предложения из первой не вытекает.)
Да, мне трудно работать над этим проектом и задачи кажутся невыполнимыми, но я справлюсь.
Да, мне трудно работать над этим проектом и задачи кажутся невыполнимыми, но я справлюсь.
Для проверки утвердительное слово ДА можно заменить вводным словом примерно с тем же утвердительным значением, а вводные слова относятся к общим элементам:
Действительно, мне трудно работать над этим проектом и задачи кажутся невыполнимыми, но я справлюсь.
ДЕЙСТВИТЕЛЬНО. I. нареч. В действительности, подлинно, в самом деле. Он д. очень устал. II. вводн. сл. Подтверждает чью-л. мысль, выражает уверенность в чём-л. На этот раз, д., он прав. III. частица. Употр. для выражения утверждения; да, верно. Он так сказал? - Д.
Если не поставить запятую после "да", то это будет уже не подтверждение. "Да мне трудно работать..." подобно: "да не хочу я", "да что вы в самом деле", "да иди ты". После "нет" запятая так и так напрашивается.