Мысль выражена туманно, не видно процесса превращения (акта обращения) в современный ритуал причастия.
Например:
Затем начали считать, что этом таинстве символически объединются и живые и мёртвые, — так с течением времени агапэ была обращена в современный ритуал причастия.
А если вообще убрать так, то потеряется ощущение процесса. Дескать, была обращена, а как — не указано.