Мысль выражена туманно, не видно процесса превращения (акта обращения) в современный ритуал причастия.

Например:  

**Затем начали считать, что этом таинстве символически объединются и живые и мёртвые, так с течением времени агапэ была обращена в современный ритуал причастия.**

А если вообще убрать *так*, то потеряется ощущение процесса. Дескать, была обращена, а как — не указано.