И то, и другое верно, когда употребляется с пониманием какого характера лоджия. Лоджия может быть мелкой, являющейся по сути частью общего балкона-галереи (ваш прим.: на крохотной лоджии), а также — глубокой, более уединённой, практически — комнатой, но вовне открытой (в лоджии, ср.: в ложе).
В последние два десятилетия неуправляемый процесс остекления и включения лоджий в состав отапливаемых площадей понятие превратилось в фантом. Именно о такой «лоджии» пишет А. Маринина, — той, от которой остался звук и выступающие простенки. «В лоджии» — в её случае означает — в том месте теперешней комнаты, где была лоджия.