Вообще-то есть такое понятие как фонетическая инверсия, "Перлат" мог вырасти из "Прелата" в силу ослышки или сознательного искажения. Но мне в принципе не нравятся обе версии - что ихиз "прелата", что из "перла". Во втором случае появление "латинского" суффикса припросто необъяснимо, а "прелат" само по себе очень странно как основа для фамилии.
Так что ничего не остается, кроме как объяснять причудами предков. Взяли, например, да "перевели" на латинский фамилию "Жемчугов". Такие случаи известны...
Есть, правда, некий технический термин perlator - устройство для насыщения воды воздухом, но оно, кажется, происходит от некого искусственно образованного имени собственного. Для основы фамилии не годится.