От существительного меридиан прилагательное можно образовать двумя способами: меридиан - меридиан/н/ый, меридиан - мериди/ональн/ый.
Суффикс -ональн- выделяется в словах: функция - функциональный, пропорция - пропорциональный.
Можно также сравнить: диагональ/н/ый - мериди/ональн/ый. Оба слова (меридиан и диагональ) пришли в русский язык в начале XVIII века, прилагательные "меридиональный и меридианный" известны с XIX века, здесь возможно взаимное влияние форм.