Правильно:
Мы сделаем это, конечно, если нам никто не помешает.
Пояснение
Розенталь, пункт 7
7. Если между главной и придаточной частями
сложноподчиненного предложения стоит вводное слово, то
оно выделяется запятыми на общих основаниях: Он подумал,
возможно, что я не хочу с ним встречаться; Если есть
спрос на что-либо, значит, будет и предложение.
Отнесение вводного слова по смыслу к главной или
придаточной части определяется условиями контекста. Ср.:
Он сердился, по-видимому, потому что лицо его было
возбуждённым — вводное слово относится к главной части
(возбужденное лицо может быть следствием, а не причиной
состояния субъекта); Он торопился потому, по-видимому,
что боялся опоздать на заседание — вводное слово
относится к придаточной части, о чем свидетельствует
расчлененность сложного подчинительного союза. [См. § 34,
п. 2.]
Розенталь § 25. Вводные слова и словосочетания
7. Вводное слово (сочетание), стоящее перед
сравнительным оборотом (с союзом как), целевым
оборотом (с союзом чтобы) и т. д., отделяется от
них запятой на основании общего правила: Всё это
мне показалось странным, впрочем, как и другим;
Студент на минуту задумался, вероятно, чтобы
точнее сформулировать свой ответ. Обычно в этих
случаях вводное слово относится к последующей
части предложения.
- Для больше определенности вводное слово можно разместить внутри придаточного:
Мы сделаем это, если, конечно, нам никто не помешает.
- Вводные слова могут не обособляться в БСП (правило Лопатина),
§ 94. Лось шел скачками в сторону озер, должно быть спешил на водопой (Пауст.); Послышался резкий стук, должно быть сорвалась ставня (Ч.).
Но Розенталь предлагает другое решение (в случае неясности добавлять тире): Розенталь § 43. Запятая и точка с запятой в бессоюзном сложном предложении (п.3)