Я обернулся, но его уже не было — скорее всего, побежал ябедничать.
Да, пунктуация верна. Тире здесь самый подходящий знак. Только часть после тире не оборот, а целое предложение, которое можно считать присоединительным.
Рассказчик высказывает своё предположение, попутную мысль.
Присоединительные конструкции (справочник Розенталя):
1. Присоединительные члены предложения, которые содержат дополнительные разъяснения или замечания, вводимые в середину либо в конец высказывания, выделяются (или отделяются) запятыми (реже используются тире, точка, многоточие).
<...>
4. Знаками препинания выделяются не только присоединительные члены предложения, но и присоединительные предложения.
Присоединительные конструкции (Валгина Н. С., Розенталь Д. Э., Фомина М. И. Современный русский язык):
Функция дополнительно возникшего высказывания определяет основные значения присоединительных конструкций: они имеют характер добавочных сообщений, уточняющих, поясняющих и развивающих основное высказывание. Все эти качества позволяют считать присоединительные конструкции особым синтаксическим явлением. Цель использования присоединения — придать речи особые смысловые и экспрессивно-стилистические оттенки, сообщить отдельным членам высказывания большую смысловую и эмоциональную нагрузку.