"Зулейха открывает глаза":
Так было положено начало семрукскому колхозу и успешно закрыт второй пункт повестки дня, к тому времени уже перевалившего за полночь.
Как правильно поставить ударение: на само слово или на предлог?
Я бы поставил на предлог. Вообще подобные образования обычно допускают двоякое ударение, но в художественном тексте, да еще с учетом относительной современности действия, ударение просится именно туда.
Тут есть возражение, что такое ударение более свойственно наречию, в то время как в тексте оборот явно не в наречном значении. Но, думаю, это не так существенно, чтобы говорить об энклитическом построении (безударном предлоге).
В разных источниках указывается, что ударение падает именно на предлог.
http://slovonline.ru/slovar_udarenie/b-8/id-35723/za_polnoch.html
http://gramota.ru/slovari/dic/?all=x&word=полночь || Здесь же словарь "Русское словесное ударение".
И даже отдельным пунктом в толковом словаре Ефремовой:
https://www.efremova.info/word/za_polnoch.html