В душе всё бушУет, как обЫчно.
Как обычно — здесь вводное слово, оборот не обособляется только в том случае, если входит в сказуемое (тесно связано со сказуемым), например: А дальше все опять было как обычно (В. Пелевин).
Пауза есть как при обособлении, так и без обособления вводного слова, просто во втором случае она обозначена как перелом интонации (имеет меньшую длительность).
В обоих случаях предложение состоит из двух фраз, а каждая фраза имеет тоническое ударение. При отсутствии обособления это выглядит так: В душе всё бушУет //как обЫчно.
Но как обычно — это (по смыслу) не обстоятельство образа действия. Нельзя сказать, что бушует каким-то определенным образом. Бушует, потому что так происходит часто (обычно).
Поэтому вводное слово нужно обособить.