Автор оставляет простор для понимания и толкования сказанного, а это — недостаток. Текст должен быть составлен так, чтобы не вызывать вопросы о смысле сказанного.
Вот мне кажется, что заполнять таблицы придется сидя за компьютером, а остальные виды работы (работа с документами, ведение счетов и другие важные дела) не будут связаны с сидением за компьютером. Расстановка запятых не противоречит и такому пониманию.
Дополнение:
Я имел в виду, что работа с документами, ведение счетов и другие важные дела связаны с "сидеть за компьютером". Как тогда поступить?
Расстановкой союзов и запятых проблему не решишь.
Мой вариант:
Можно работать в отделах, где вы будете, сидя за компьютером, заполнять таблицы в «1С», работать с документами, вести счета и заниматься другими важными задачами.