Мне на слух более звучным кажется вариант:
не в чем было себя упрекнуть (ударение на не)
При этом в литературе в редких случаях встречается вариант:
Скорее всего, ей не в чём было себя упрекнуть.
Ему не в чём было оправдываться.
Который мне кажется менее естественным. Помогите разобраться.