В словаре Потихи (1964) в слове "смутиться" приставка не выделяется. Смутиться от слова смута. В словаре Тихонова (онлайн-версия) есть существительное: смущение, приставка здесь выделяется.
Мне кажется логичным выделять приставку с. Ведь у него есть однокоренные слова как с другими приставками (помутиться, возмутить), так и без них (мутить).
Что вы думаете?