На сайте Oshibok-Net.ru пишут, что слово различие, образовано от глагола "различать" при помощи суффикса -иj-.-иj-. Далее пишут: ""...вначале приставка раз-раз- присоединилась к основе существительного ликлик (в древности ликъликъ) одновременно с древним суффиксом существительного -j--j- (этот суффикс преобразовал звук К в Ч, т.е е. современный звук Ч возник на месте древнего сочетания 2-х звуков — к и j), в результате было создано древнее существительное различьразличь («различие»); - затем на базе существительного различьразличь при помощи суффикса было создано прилагательное различный"различный".
Т. е. вначале образовалось слово "различие", и на его базе — производные слова.
Каким образом сегодня слово различие образуется от глагола? Если, например,произошли произошли какие-н.нибудь исторические изменения, производное слово исчезло бы, тогда было бы понятней. Но в данном случае исторически оно само является производящемпроизводящим.
P.S S.На На мой вопрос , как так получилось,ответили ответили: "Следует различать историческое и современное словообразование". (Отвечают профессиональные лингвисты).)